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『味苦，平。主諸熱，黃疸，腸澼泄痢，逐水，下血閉，惡瘡疽蝕，火瘍。』（【本經】）
黃芩泄實火、除濕熱，其性寒也。凡壯熱煩渴，肺熱咳嗽，濕熱下利，黃疸熱淋，吐衄崩漏，目赤腫痛，胎動不安，癰腫疔瘡並皆治之。【本經】謂：諸熱者，乃氣血分熱，風熱，濕熱，痰熱，五臟六腑之熱也。陳修園、徐靈胎以黃芩色黃屬脾土，其中空似腸胃，爲腸胃濕熱之用藥；黃元御以黃芩清相火，止呃逆，除痞熱，退鬱蒸，爲肝膽少陽經之用藥。
【傷寒論】葛根芩連湯治傷寒表證未解，醫反誤下，邪陷陽明致成熱利，黃芩清泄里熱，苦堅胃腸以止利，今用於溫病初起，即見下利壯熱，煩躁口渴，小便短赤，所利之物臭穢異常，肛門灼熱疼痛者；黃芩湯治身熱口苦，腹痛下利膿血，黃芩清熱解毒治痢也，今用於急性痢疾腸炎，又用於寒邪深伏，已經化熱之溫病，黃芩苦寒直清氣分之實熱邪火也；小柴胡湯本治寒熱往來之中風，大柴胡湯治發熱、汗出之少陽熱結，其法亦爲後世採用治療暑溫時疫之濕遏熱郁，三焦不利，肝膽相火熾盛者，惟必用黃芩以瀉伏熱鬱火也；乾薑芩連人參湯治傷寒本自寒下，脾氣內陷，下利益甚，嘔吐彌增，拒食不納，黃芩泄熱於上，乾薑溫中，人參益胃，陰陽升降復常，寒熱格拒自然可愈；瀉心湯四方皆治傷寒心下痞滿，皆重用黃芩泄鬱火熱結也。
外感疫毒、濕溫，黃芩皆系要藥，【醫方集解】普濟消毒飲治大頭瘟流行蔓延甚廣，惡寒發熱，頭面紅腫焮痛，目難開，咽喉不利，舌燥口渴，黃芩清熱解毒，消腫逐水也；東垣二黃湯（黃芩、黃連（俱用酒炒），甘草各等分）亦治大頭天行疫病；三黃石膏湯（生石膏、黃芩、黃柏、豆豉、麻黃、梔子）治瘟證高熱發狂不識人，其力甚雄。
貴州潘星北認爲猩紅熱爲外感溫熱疫毒，熏灼咽喉紅腫糜爛，外竄肌膚爲丹痧，病分三期，均以黃芩清熱解毒爲主，輔以金銀花、元參、射干、丹皮、大黃、生地、連翹、梔子甘草爲治。
【重訂通俗傷寒論】蒿芩清膽湯以黃芩苦寒清泄膽府邪熱，青蒿清透少陽邪熱並爲君藥，治濕熱瀰漫氣分，熱重於濕，寒熱如瘧，小便黃少者。貴州陸鴻賓氏以之治變應性亞敗血症之寒溫兩感者有良效。
【溫熱經緯】甘露消毒丹重用黃芩、滑石、茵陳三藥治濕溫時疫，邪在氣分之發熱睏倦，胸悶腹脹，發黃頤腫等症，夏令暑濕季節最爲常用。貴州陳慈煦氏以之治療不明原因持續高熱，其證或有寒戰，入夜盜汗，微咳，膝關節時而酸痛，口渴而思熱飲。余認爲凡屬濕熱郁滯氣分者，無論沙門菌屬感染、傷寒、病毒感染抑或不明原因之發熱，皆可辨而用之。
黃芩涼血止血。【金匱】瀉心湯，以大黃、黃芩、黃連治邪火內熾，迫血妄行以致吐血衄血者，氣火下降，血亦漸趨寧靜也，今用治胃、十二指腸潰瘍出血者。
貴州陸鴻賓氏以黃芩加養陰、清涼、除濕之藥，爲養陰清膈湯、滋陰涼血湯、清絡清營湯，治療無症狀之頑固持續性腎小球炎性血尿，每有顯效也。又用黃芩與龍膽、梔子、知母等清泄肝膽三焦命門相火，治療冬至後發作之頑固性鼻衄。此非一般之邪熱，乃內生陽氣所過也。
吳讓德有清涼止血湯（黃芩、阿膠珠、茜草根、側柏葉、生地各30克，甘草15克）治鼻血、吐血不止者。吐衄反覆發作難止，量多血色鮮紅者，以五臟結熱尤重也，真乃血熱妄行，直須此類大劑涼血止血藥如本方者。
下血及吐衄，婦人血崩，血色暗淡，四肢不溫，面色萎黃，舌淡苔白脈沉細無力者，黃土湯以黃芩苦以堅陰，合以溫陽健脾，滋陰養血之藥，剛柔相濟，乃脾氣虛寒血證之良方也。
黃芩兼行沖脈，古方一味子芩丸，治女子血熱經水暴下不止者甚效。余治子宮肌瘤不正常出血者，以子宮氣血分之濕熱也，每以芩連四物湯爲主治方，此北京劉奉五先生經驗也。胎動不安，若爲血虛濕熱類證，黃芩堅陰清熱，血復而濕熱去，故胎安也，當與益氣養血方共用，傅青主利氣泄火湯（人參、白朮、甘草、熟地、當歸酒洗、白芍、芡實炒、黃芩酒炒）甚妙。
黃芩又爲痰熱類證要藥，其所以除痰，亦去濕熱之藥效也，痰多濕熱所釀成也。王隱君滾痰丸（大黃、黃芩、礞石（煅金色）、沉香，水泛丸。）主治實熱老痰，發爲癲狂驚悸，或怔忡昏迷，或咳喘痰稠，或胸脘痞悶，或眩暈痰多，大便秘結，舌苔黃厚而膩，脈滑數有力者。用本方得當，可治數十種病證，余常以之治精神分裂症、老年痴呆、呼吸道感染、急性肺炎、梅尼埃症候群、潰瘍性結腸炎、疫毒性感冒、多發性癤腫之屬痰熱內蓄者。
【本草經疏】謂黃芩『脾肺虛熱者忌之，凡中寒作泄，中寒腹痛，肝腎虛而少腹痛，血虛腹痛，脾虛泄瀉，腎虛溏瀉，脾虛水腫，血枯經閉，氣虛小便不利，肺受寒邪喘咳，及血虛胎不安，陰虛淋露，法並禁用』。以黃芩苦寒瀉實火，主諸熱故也。
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